Le mécénat ne peut plus s'appuyer sur les seules intuitions d'un fondateur.

Pour réussir auprès des publics auxquels il souhaite apporter des solutions, il doit aller à la rencontre de ces publics et co-construire avec eux ces solutions. C'est ce que demande la Fondation RTE aux associations qu'elle soutient. C'est aussi un principe clé de sa gouvernance : la Fondation RTE a toujours souhaité que le monde rurale y prenne une part active.

En outre, la Fondation RTE a été placée sous l'égide de la Fondation de France et bénéficie de son expertise en matière de mécénat et de gouvernance.

Depuis 2018, les représentants de l'entreprise au sein du Comité exécutif, organe décisionnel de la Fondation, sont devenus minoritaires pour davantage associer les représentants des territoires ruraux et de l'Economie Sociale et Solidaire. Les débats en sont menés par le Président de la Fondation, Jean-Pierre Desbrosses, désigné par l'entreprise RTE. Il est composé de trois collèges : 

• Collège A : les représentants de l'entreprise RTE
  • Gwenaëlle Bongiovanni - Directrice adjointe de Développement et ingénierie
  • Frédéric Dohet - Directeur RSE
  • Thérèse Boussard - Directrice générale du Pôle Gestion de l'infrastructure & membre du directoire
  • Philippe Pillevesse - Directeur des relations institutionnelles
  • Laurent Cantat-Lampin - Délégué RTE Lille
  • Représentant des OS
     
• Collège B : les structures représentatives du monde rural
  • Raphaelle Gasc - Directrice de l'UNCPIE 
    en alternance avec Manon Rousselot-Pailley - MRJC
  • Michel Fournier - Président de l'AMRF
  • Magali Martin - Directrice des programmes de l'ANCT
  • Guylaine Brohan - Présidente de la Fédération Nationale des Familles Rurales 
  • Arnaud Delestre - Président de la Chambre d'agriculture de l'Yonne
     
• Collège C : les personnalités qualifiées
  • Didier Christin - Directeur de Sol et Civilisation
  • Jean-Guy Henckel - Fondateur du Réseau Cocagne
  • Ambroise de Montbel - Enseignant et chercheur AgroParistech Paris
  • Jean Mallot - élu Saint Pourcain
  • Vanessa Couvreux-Chapeau - co-fondatrice et co-directrice de l'association Habit'âge
  • Pierre Weick - ancien directeur Fédération des PNR

Une équipe permanente met en oeuvre les décisions du Comité exécutif dans le cadre des grandes orientations qui sont fixées à intervalles réguliers par l'entreprise fondatrice.